Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zfp235Q499D5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Zfp235Q499D5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Zfp235Q499D5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp235Q499D5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms