Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Snx25Q3ZT31 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx25Q3ZT31 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snx25Q3ZT31 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms