Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810049J17RikQ3V2G9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms