Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc110Q3V125 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc110Q3V125 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms