Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm906Q3V0M1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms