Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Garnl3Q3V0G7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Garnl3Q3V0G7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms