Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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