Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc160Q3UYG1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms