Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5aQ3UXZ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm5aQ3UXZ9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms