Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms