Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim40Q3UWA4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim40Q3UWA4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms