Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms