Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skap1Q3UUV5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skap1Q3UUV5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms