Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm28047Q3US59 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm28047Q3US59 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms