Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl4Q3URY0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl4Q3URY0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl4Q3URY0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl4Q3URY0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl4Q3URY0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rtl4Q3URY0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rtl4Q3URY0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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