Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5460Q3UQ97 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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