Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
E130208F15RikQ3UPV3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms