Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl2Q3UMU9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms