Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms