Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ceacam5Q3UKK2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ceacam5Q3UKK2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms