Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms