Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod2Q3UHZ5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod2Q3UHZ5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms