Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccser2Q3UHI0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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