Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Pitpnm3Q3UHE1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms