Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trafd1Q3UDK1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trafd1Q3UDK1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms