Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsrp1Q3UC65 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms