Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U7U4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U7U4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U7U4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms