Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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