Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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