Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl21Q3U410 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms