Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gse1Q3U3C9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms