Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Otud5Q3U2S4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otud5Q3U2S4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Otud5Q3U2S4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud5Q3U2S4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud5Q3U2S4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud5Q3U2S4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud5Q3U2S4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otud5Q3U2S4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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