Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms