Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc28Q3TX51 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms