Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxw18Q3TSA9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms