Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc10Q3TLI0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc10Q3TLI0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms