Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca4Q3TKT4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Smarca4Q3TKT4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms