Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4cQ3TKR3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms