Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms