Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam107bQ3TGF2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam107bQ3TGF2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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