Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp444Q3TDV8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms