Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap5b1Q3TAP4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap5b1Q3TAP4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms