Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms