Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hdgfl1Q2VPR5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl1Q2VPR5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms