Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpm1Q2TV84 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms