Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms