Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fgfbp3Q1HCM0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms