Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fam171bQ14CH0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam171bQ14CH0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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