Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd9Q14BI7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd9Q14BI7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd9Q14BI7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms