Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam47cQ14BE7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Fam47cQ14BE7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Fam47cQ14BE7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Fam47cQ14BE7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam47cQ14BE7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms